Theo đó, việc tính lệ phí cấp giấy đăng ký và biển số mới được chia thành 3 khu vực: khu vực I (gồm Hà Nội, TP. HCM); khu vực II (gồm các thành phố trực thuộc Trung ương, trực thuộc tỉnh và các thị xã) và các vùng còn lại thuộc khu vực III. Mỗi khu vực có các mức phí khác nhau, áp dụng đối với các trường hợp cấp mới, lần đầu đăng ký xe và cấp lại.
Cụ thể, từ ngày 05/02/2011, lệ phí cấp mới biển số cho ô tô con dưới 10 chỗ (kể cả lái xe) không hoạt động kinh doanh vận tải hành khách ở Hà Nội và TP. HCM sẽ từ 2 triệu - 20 triệu đồng/lần/xe. Lệ phí đăng ký và cấp mới biển số các loại ô tô kể trên ở khu vực II và III từ 150.000 đồng - 1 triệu đồng/lần/xe.

Tương tự đối với xe máy, mức lệ phí cấp biển số xe máy cũng khác nhau tùy thuộc vào khu vực và trị giá của xe máy (trị giá của xe máy là giá tính lệ phí trước bạ tại thời điểm đăng ký). Xe có giá từ 15 triệu đồng trở xuống, lệ phí cấp biển số tại khu vực I là 500.000 đồng - 1 triệu đồng/lần/xe. Xe có trị giá trên 15 triệu đồng tới 40 triệu đồng, lệ phí là 1 triệu - 2 triệu đồng/lần/xe; trị giá trên 40 triệu đồng, lệ phí là 2 triệu - 4 triệu đồng/lần/xe. Khu vực II và III, lệ phí đăng ký và cấp mới biển số xe đối với các loại xe trên chỉ từ 50.000 đồng - 800.000 đồng/lần/xe.
Cũng theo Thông tư này, các loại ô tô và xe máy cấp lại biển số cũng thay đổi mức lệ phí căn cứ theo khu vực. Trong đó, mức phổ biến đối với các loại ô tô cấp lại biển số là 50.000 đồng, 100.000 đồng và 150.000 đồng; riêng các loại xe máy cấp lại biển số sẽ có mức phí là 30.000 đồng. Lệ phí cấp giấy đăng ký và biển số tạm thời; đóng lại khung, số máy là 50.000 đồng/lần/xe đối với tất cả các khu vực.
Bộ Tài chính giao HĐND TP. Hà Nội và TP. HCM căn cứ vào Biểu mức thu trên để ban hành mức thu cụ thể phù hợp với tình hình thực tế tại địa phương.

Như vậy, mức lệ phí cấp giấy đăng ký và biển số xe theo quy định tại Thông tư này đều cao hơn mức lệ phí hiện hành được quy định tại Thông tư số 34/2003/TT-BTC ngày 16/4/2003 và Thông tư số 115/2001/TT-BTC ngày 03/12/2004, mức cao nhất là 20 triệu đồng.

Thông tư có hiệu lực thi hành từ ngày 05/02/2010./.